DNA的復制是一個(gè)邊解旋邊復制的過(guò)程。復制開(kāi)始時(shí),DNA分子首先利用細胞提供的能量,在解旋酶的作用下,把兩條螺旋的雙鏈解開(kāi),這個(gè)過(guò)程叫解旋。然后,以解開(kāi)的每一段母鏈為模板,以周?chē)h(huán)境中的四種脫氧核苷酸為原料,按照堿基配對互補配對原則,在DNA聚合酶的作用下,各自合成與母鏈互補的一段子鏈。隨著(zhù)解旋過(guò)程的進(jìn)行,新合成的子鏈也不斷地延伸,同時(shí),每條子鏈與其母鏈盤(pán)繞成雙螺旋結構,從而各形成一個(gè)新的DNA分子。這樣,復制結束后,一個(gè)DNA分子,通過(guò)細胞分裂分配到兩個(gè)子細胞中去!
注:復制時(shí)遵循堿基互補配對原則,復制發(fā)生在細胞分裂的間期。
DNA是遺傳信息的載體,故親代DNA必須以自身分子為模板準確的復制成兩個(gè)拷貝,并分配到兩個(gè)子細胞中去,完成其遺傳信息載體的使命。而DNA的雙鏈結構對于維持這類(lèi)遺傳物質(zhì)的穩定性和復制的準確性都是極為重要的。
(一)DNA的半保留復制
Waston和Click在提出DNA雙螺旋結構模型時(shí)曾就DNA復制過(guò)程進(jìn)行過(guò)研究,他們推測,DNA在復制過(guò)程中堿基間的氫鍵首先斷裂,雙螺旋解旋分開(kāi),每條鏈分別作模板合成新鏈,每個(gè)子代DNA的一條鏈來(lái)自親代,另一條則是新合成的,故稱(chēng)之為半保留式復制(semiconservative replication)。 1958年Meselson和Stahl進(jìn)行了如圖8-3-5的實(shí)驗證明了DNA分子是以半保留方式進(jìn)行自我復制的。圖8-3-5 Meselson和Stahl證明DNA半保留復制的實(shí)驗 (二)DNA復制的起始,方向和速度
DNA在復制時(shí),雙鏈DNA解旋成兩股分別進(jìn)行。其復制過(guò)程的復制起點(diǎn)呈現叉子的形式,故稱(chēng)復制叉。以復制叉向前移動(dòng)的方向為標準,一條模板鏈為3’—〉5’走向,在其上DNA能以5’—〉3’方向連續合成,稱(chēng)為前導鏈(leading strand);另一條模板鏈為5’—〉3’走向,在其上DNA也是5’—〉3’方向合成,但與復制叉移動(dòng)的方向正好相反,故隨著(zhù)復制叉的移動(dòng)形成許多不連續的岡崎片段,最后在連成一條完整的DNA鏈,該鏈稱(chēng)為后隨鏈(lagging strand)。實(shí)驗證明DNA的復制是由一個(gè)固定的起始點(diǎn)開(kāi)始的。一般把生物體的單個(gè)復制單位稱(chēng)為復制子。一個(gè)復制子只含一個(gè)復制起點(diǎn)。一般說(shuō),細菌,病毒即線(xiàn)粒體DNA分子均作為單個(gè)復制子完成其復制,真核生物基因組可以同時(shí)在多個(gè)復制起點(diǎn)上進(jìn)行雙向復制,即它們的基因組包括多個(gè)復制子。多方面的實(shí)驗結果表明,大多數生物內DNA的復制都是從固定的起始點(diǎn)以雙向等速方式進(jìn)行的。復制叉以DNA分子上某一特定順序為起始點(diǎn),向兩個(gè)方向等速生長(cháng)前進(jìn)。圖8-3-6 DNA復制過(guò)程 DNA復制過(guò)程
(三)DNA復制過(guò)程
以原核生物DNA復制過(guò)程予以簡(jiǎn)要說(shuō)明
1.DNA雙螺旋的解旋
DNA在復制時(shí),其雙鏈首先解開(kāi),形成復制叉,而復制叉的形成則是由多種蛋白質(zhì)及酶參與的較復雜的復制過(guò)程
ssbDNA蛋白是較牢固的結合在單鏈DNA上的蛋白質(zhì)。原核生物ssbDNA蛋白與DNA結合時(shí)表現出協(xié)同效應:若第1個(gè)ssbDNA蛋白結合到DNA上去能力為1,第2個(gè)的結合能力可高達103;真核生物細胞中的ssbDNA蛋白與單鏈DNA結合時(shí)則不表現上述效應。ssbDNA蛋白的作用是保證解旋酶解開(kāi)的單鏈在復制完成前能保持單鏈結構,它以四聚體的形式存在于復制叉處,待單鏈復制后才脫下來(lái),重新循環(huán)。所以,ssbDNA蛋白只保持單鏈的存在,不起解旋作用。(2)DNA解鏈酶(DNA helicase) DNA解鏈酶能通過(guò)水解ATP獲得能量以解開(kāi)雙鏈DNA。這種解鏈酶分解ATP的活性依賴(lài)于單鏈DNA的存在。如果雙鏈DNA中有單鏈末端或切口,則DNA解鏈酶可以首先結合在這一部分,然后逐步向雙鏈方向移動(dòng)。復制時(shí),大部分DNA解旋酶可沿滯后模板的5’—〉3’方向并隨著(zhù)復制叉的前進(jìn)而移動(dòng),只有個(gè)別解旋酶(Rep蛋白)是沿著(zhù)3’—〉5’方向移動(dòng)的。故推測Rep蛋白和特定DNA解鏈酶是分別在DNA的兩條母鏈上協(xié)同作用以解開(kāi)雙鏈DNA。(3)DNA解鏈過(guò)程 DNA在復制前不僅是雙螺旋而且處于超螺旋狀態(tài),而超螺旋狀態(tài)的存在是解鏈前的必須結構狀態(tài),參與解鏈的除解鏈酶外還有一些特定蛋白質(zhì),如大腸桿菌中的Dna蛋白等。一旦DNA局部雙鏈解開(kāi),就必須有ssbDNA蛋白以穩定解開(kāi)的單鏈,保證此局部不會(huì )恢復成雙鏈。兩條單鏈DNA復制的引發(fā)過(guò)程有所差異,但是不論是前導鏈還是后隨鏈,都需要一段RNA引物用于開(kāi)始子鏈DNA的合成。因此前導鏈與后隨鏈的差別在于前者從復制起始點(diǎn)開(kāi)始按5’—3’持續的合成下去,不形成岡崎片段,后者則隨著(zhù)復制叉的出現,不斷合成長(cháng)約2—3kb的岡崎片段。
2.岡崎片段與半不連續復制
因DNA的兩條鏈是反向平行的,故在復制叉附近解開(kāi)的DNA鏈,一條是5’—〉3’方向,另一條是3’—〉5’方向,兩個(gè)模板極性不同。所有已知DNA聚合酶合成方向均是5’—〉3’方向,不是3’—〉5’方向,因而無(wú)法解釋DNA的兩條鏈同時(shí)進(jìn)行復制的問(wèn)題。為解釋DNA兩條鏈各自模板合成子鏈等速復制現象,日本學(xué)者岡崎(Okazaki)等人提出了DNA的半連續復制(semidiscontinuous replication)模型。1968年岡崎用3H脫氧胸苷短時(shí)間標記大腸桿菌,提取DNA,變性后用超離心方法得到了許多3H標記的,被后人稱(chēng)作岡崎片段的DNA。延長(cháng)標記時(shí)間后,岡崎片段可轉變?yōu)槌墒霥NA鏈,因此這些片段必然是復制過(guò)程中的中間產(chǎn)物。另一個(gè)實(shí)驗也證明DNA復制過(guò)程中首先合成較小的片段,即用DNA連接酶溫度敏感突變株進(jìn)行試驗,在連接酶不起作用的溫度下,便有大量小DNA片段積累,表明DNA復制過(guò)程中至少有一條鏈首先合成較短的片段,然后再由連接酶鏈成大分子DNA。一般說(shuō),原核生物的岡崎片段比真核生物的長(cháng)。深入研究還證明,前導鏈的連續復制和滯后鏈的不連續復制在生物界具有普遍性,故稱(chēng)為DNA雙螺旋的半不連續復制。
3.復制的引發(fā)和終止
所有的DNA的復制都是從一個(gè)固定的起始點(diǎn)開(kāi)始的,而DNA聚合酶只能延長(cháng)已存在的DNA鏈,不能從頭合成DNA鏈,新DNA的復制是如何形成的?經(jīng)大量實(shí)驗研究證明,DNA復制時(shí),往往先由RNA聚合酶在DNA模板上合成一段RNA引物,再由聚合酶從RNA引物3’端開(kāi)始合成新的DNA鏈。對于前導鏈來(lái)說(shuō),這一引發(fā)過(guò)程比較簡(jiǎn)單,只要有一段RNA引物,DNA聚合酶就能以此為起點(diǎn),一直合成下去。對于后隨鏈,引發(fā)過(guò)程較為復雜,需要多種蛋白質(zhì)和酶參與。后隨鏈的引發(fā)過(guò)程由引發(fā)體來(lái)完成。引發(fā)體由6種蛋白質(zhì)構成,預引體或引體前體把這6種蛋白質(zhì)結合在一起并和引發(fā)酶或引物過(guò)程酶進(jìn)一步組裝形成引發(fā)體。引發(fā)體似火車(chē)頭一樣在后隨鏈分叉的方向前進(jìn),并在模板上斷斷續續的引發(fā)生成滯后鏈的引物RNA短鏈,再由DNA聚合酶 III 作用合成DNA,直至遇到下一個(gè)引物或岡崎片段為止。由RNA酶H降解RNA引物并由DNA聚合酶 I 將缺口補齊,再由DNA連接酶將每?jì)蓚€(gè)岡崎片段連在一起形成大分子DNA.。 (四)端粒和端粒酶
1941年美籍印度人麥克林托克(Mc Clintock)就提出了端粒(telomere)的假說(shuō),認為染色體末端必然存在一種特殊結構——端粒。已知染色體端粒的作用至少有二:① 保護染色體末端免受損傷,使染色體保持穩定;② 與核纖層相連,使染色體得以定位。 在弄清楚DNA復制過(guò)程之后,20世紀70年代科學(xué)家對DNA復制時(shí)新鏈5’端的RNA引物被切除后,空缺是如何被填補的提出了質(zhì)疑。如不填補豈不是DNA每復制一次就短一點(diǎn)。以后隨鏈復制為例,當RNA引物被切除后,岡崎片段之間是由DNA聚合酶 I催化合成的DNA填補之,然后再由DNA連接酶將它們連接成一條完整的鏈。但是DNA聚合酶 I 催化合成DNA時(shí),需要自由3’—OH作為引物,最后余下子鏈的5’無(wú)法填補,于是染色體就短了一點(diǎn)。 在正常體細胞中普遍存在著(zhù)染色體酶復制一次端粒就短一次的現象。人們推測,可能一旦端粒縮短到某一閾限長(cháng)度一下時(shí),他們就會(huì )發(fā)出一個(gè)警報,指令細胞進(jìn)入衰老;或許是當細胞判斷出它們的染色體已變得太短了,于是分裂也就停止了,造成正常體細胞壽命有一定界限。但是在癌細胞中染色體端粒卻一直維持在一定長(cháng)度上,這是為什么?這是因為DNA復制后,把染色體末端短缺部分補上需要端粒酶,這是一種含有RNA的酶,它既解決了模板,又解決了引物的問(wèn)題。在生殖細胞和85%癌細胞中都測出了端粒酶具有活性,但是在正常體細胞中卻無(wú)活性,20世紀90年代中期,Blackburn首次在原生動(dòng)物中克隆出端粒酶基因。
端粒酶在癌細胞中具有活性,它不僅使癌細胞可以不斷分裂增生,而且它為癌變前的細胞或已經(jīng)是癌性的細胞提供了時(shí)間,以積累附加的突變,即等于增加它們復制,侵入和最終轉移的能力。同時(shí)人們也由此萌生了開(kāi)發(fā)以端粒為靶的藥物,即通過(guò)抑制癌細胞中端粒酶活性而達到治療癌癥的目的。
至于真核細胞DNA末端的結構特點(diǎn),早就在1978年Blackburn就以原生動(dòng)物四膜蟲(chóng)(一種纖毛蟲(chóng))為例說(shuō)明之:① 迥紋形式的發(fā)夾環(huán);② 僅由C,A組成的簡(jiǎn)單序列大量重復(C4A2)20~70;③ 鏈上有許多缺口(nicks)。