測序深度,測序得到的堿基總量(bp)與基因組大小(Genome)的比值,它是評價(jià)測序量的指標之一。

基本內容

概念介紹

測序深度(Sequencing Depth):測序得到的堿基總量(bp)與基因組大小(Genome)的比值,它是評價(jià)測序量的指標之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個(gè)正相關(guān)的關(guān)系,測序帶來(lái)的錯誤率或假陽(yáng)性結果會(huì )隨著(zhù)測序深度的提升而下降。重測序的個(gè)體,如果采用的是雙末端或Mate-Pair方案,當測序深度在10~15X以上時(shí),基因組覆蓋度和測序錯誤率控制均得以保證。